Vermutlich hat der Provider die Ausführungszeit für PHP-Skripte begrenzt, und durch die im Laufe der Zeit immer größer gewordene Datenmenge läuft der Backup-Vorgang jetzt in einen "Timeout" hinein. Das heißt, die Datensicherung wird vom Serverbetriebssystem einfach abgebrochen.
Um das Problem zu lösen, gibt es im Grunde zwei Möglichkeiten: Entweder muss der Provider überzeugt werden, die Serverkonfiguration anzupassen und die Zeitdauer für PHP-Skripte (max_execution_time) heraufzusetzen. Oder die Sicherung der MySQL-Datenbanktabellen muss auf anderem Wege, zum Beispiel mittels phpMyAdmin durchgeführt werden.